樹木雖壽長千年，但由于人類的活動而屢遭破壞。莊子在寓言中描述“散木”因無用而保天年，高大悠古。現實中能保存至今的名木古樹多與寺廟有關。由于人們對宗教的信仰，使得寺廟周圍的樹木神化而免遭破壞，歷代相傳，蔚為壯觀。如曲阜孔廟大成門內左側有一檜挺立，高約10m,，粗可合抱，樹冠如帷蓋，青籠蒼翠，旁有一樹樁，飽經風雨而未摧，這便是馳名天下的“先師手植檜”。此檜被視為孔子思想的象征，倍受敬仰。明代鐘羽正的《孔廟手植檜歌》將古檜視為孔學興衰的象征：“此檜日茂則孔氏日興”，并與王朝的興衰相聯系：“恍惚枯榮關氣數”。孔廟中的另一景“杏壇”，其杏樹不但凝固“孔子游乎緇帷之林，坐休乎杏壇之上，弟子讀書，孔子弦歌鼓琴”的歷史故事，而且把紅花搖曳的杏樹提升到：“豈是人間凡卉比，文明終在共春熙”的神化高度。再如北京孔廟大成殿前的古柏，已有600多年歷史，“凌寒翠不奪，還暄綠更濃。”據民間傳說，明代奸相嚴嵩代嘉靖皇帝來此祭孔，被柏枝掀掉了烏紗帽，嚴被罷相后，人們稱此柏為“除奸柏”。

　　清代龔自珍《說京師翠微山》記敘了龍泉寺上之四松：“形偃神飛，白晝若雷雨;四松之蔽可千畝。”北京西山八大處香界寺山門內的古松，“雪霜知勁質，今古占嘉名”，是寺廟悠久歷史的見證。北京大覺寺寺中有被譽為“大覺六絕”的奇景珍物，其中三絕是古木：植于400年前的白玉蘭、抱塔松和6人方可合抱的古銀杏樹。