花的顏色不同主要是因為花瓣內所含化合物的成分（色素）不同。這些化合物大致可以分為兩種，即花青素和胡蘿卜素。花青素極不穩定，遇酸呈紅色，遇堿呈藍色，中性呈紫色，酸堿性的強弱還直接影響著色彩的深淺。胡蘿卜素能使花呈現出黃、橙、紅等色彩，而胡蘿卜素種類繁多，目前已知的有八十多種。自然界的植物種類繁多，它們生存的環境也各不相同，在兩種色素的作用下，植物才能開出五彩繽紛的花朵。自然界中綠色的花比較少見，這是因為形成綠色的色素主要是葉綠素，它一般存在于植物的莖葉組織中，而花瓣中很少，但是綠色的花還是存在的。例如繡球花，它的花多呈球形白色，到后期會變成藍綠色或粉紅色。一種中國原生的薔薇，其花大而呈綠色，是月季的變種。還有如稻、粟、蔥等非觀賞性植物也有很多品種的花是綠色的。當然，隨著技術的發展，人類也在利用基因、染色等方法制造出綠色的花卉，如綠玫瑰。